Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms