Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms