Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms