Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ID3Q02535 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ID3Q02535 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ID3Q02535 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ID3Q02535 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ID3Q02535 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ID3Q02535 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ID3Q02535 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ID3Q02535 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ID3Q02535 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ID3Q02535 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ID3Q02535 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms