Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms