Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms