Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCS1P62166 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCS1P62166 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCS1P62166 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCS1P62166 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCS1P62166 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCS1P62166 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCS1P62166 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCS1P62166 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCS1P62166 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCS1P62166 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCS1P62166 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCS1P62166 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCS1P62166 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCS1P62166 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCS1P62166 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCS1P62166 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCS1P62166 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCS1P62166 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCS1P62166 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms