Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMFBP60983 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMFBP60983 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMFBP60983 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMFBP60983 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMFBP60983 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GMFBP60983 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms