Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC4P59998 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms