Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms