Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABP4P57796 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABP4P57796 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABP4P57796 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CABP4P57796 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CABP4P57796 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CABP4P57796 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CABP4P57796 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms