Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms