Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX2P48431 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX2P48431 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms