Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQGAP1P46940 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms