Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP2P42575 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms