Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms