Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD38P28907 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD38P28907 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD38P28907 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD38P28907 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD38P28907 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD38P28907 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD38P28907 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD38P28907 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD38P28907 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD38P28907 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD38P28907 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD38P28907 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD38P28907 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD38P28907 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms