Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT1P26358 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms