Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPREP23469 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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