Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOP08100 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOP08100 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms