Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPBP07199 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPBP07199 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPBP07199 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPBP07199 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPBP07199 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPBP07199 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBP07199 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBP07199 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBP07199 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms