Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB2P05107 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms