Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PF4P02776 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PF4P02776 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PF4P02776 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PF4P02776 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PF4P02776 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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PF4P02776 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PF4P02776 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PF4P02776 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PF4P02776 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PF4P02776 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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