Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.019e-12■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 NCAPD3-203ENST00000525964 5025 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 PLD1-205ENST00000440204 646 ntTSL 414.65□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.119e-12■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 AGAP3-223ENST00000492234 560 ntTSL 414.22□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 SLC10A7-205ENST00000507030 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 ADAMTS6-205ENST00000464680 2742 ntTSL 511.04□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 ADAMTS6-206ENST00000470597 2850 ntTSL 1 (best)10.6□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 NCAPD3-214ENST00000534548 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 NCAPD3-208ENST00000530396 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.1□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 AC104806.2-201ENST00000502400 1991 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 SLC10A7-201ENST00000335472 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 ADAMTS6-202ENST00000381052 6956 ntTSL 27.49□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 PLD1-216ENST00000498278 996 ntTSL 56.3□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 PLD1-207ENST00000460926 1012 ntTSL 25.75□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 STX3-205ENST00000530498 690 ntTSL 217.78■□□□□ 0.444e-6■■■■■ 116.3
SF3B1O75533 ATP7B-210ENST00000634296 2328 ntTSL 513.97□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 116.2
SF3B1O75533 ATP7B-214ENST00000634810 5825 ntTSL 1 (best)13.82□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 116.2
SF3B1O75533 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 116.2
SF3B1O75533 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 116.2
SF3B1O75533 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 116.2
SF3B1O75533 ATP7B-213ENST00000634620 5653 ntTSL 1 (best)11.13□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 116.2
SF3B1O75533 ATP7B-204ENST00000400370 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 116.2
SF3B1O75533 ATP7B-205ENST00000418097 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 116.2
SF3B1O75533 ATP7B-211ENST00000634308 4321 ntTSL 1 (best)9.65□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 116.2
SF3B1O75533 ATP7B-215ENST00000634844 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 116.2
SF3B1O75533 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 116.2
SF3B1O75533 ADAM10-202ENST00000396136 2418 ntTSL 1 (best)4.25□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 116.2
SF3B1O75533 TXNDC16-202ENST00000554399 504 ntTSL 418.02■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 116.2
SF3B1O75533 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.152e-7■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 516.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 MKL1-206ENST00000422851 569 ntTSL 510.73□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 TBCD-225ENST00000576996 827 ntTSL 516.07■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 TBCD-206ENST00000571712 850 ntTSL 512.07□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 TBCD-219ENST00000576160 942 ntTSL 510.94□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 SFXN5-214ENST00000482289 895 ntTSL 1 (best)22.1■■□□□ 1.135e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 ARHGAP24-209ENST00000509300 572 ntTSL 515.4■□□□□ 0.066e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 CCDC18-201ENST00000343253 4867 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 NIPAL3-201ENST00000003912 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.696e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 ARHGAP24-212ENST00000514229 1936 ntTSL 1 (best)9.11□□□□□ -0.956e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.015e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.176e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 CCDC18-202ENST00000370276 4779 ntTSL 55.26□□□□□ -1.573e-6■■■■■ 116.1
SF3B1O75533 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 116
SF3B1O75533 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.093e-10■■■■■ 116
SF3B1O75533 EXOC4-220ENST00000486409 605 ntTSL 43.89□□□□□ -1.797e-7■■■■■ 116
SF3B1O75533 PNISR-207ENST00000478777 2422 ntTSL 29.45□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 116
SF3B1O75533 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.454e-6■■■■■ 116
SF3B1O75533 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.84e-6■■■■■ 116
SF3B1O75533 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 116
SF3B1O75533 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 116
SF3B1O75533 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 116
SF3B1O75533 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 116
SF3B1O75533 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 116
SF3B1O75533 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 116
SF3B1O75533 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 RAB7A-207ENST00000491681 552 ntTSL 25.41□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 BSCL2-211ENST00000448568 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 323.48■■□□□ 1.353e-7■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.853e-6■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 ACLY-208ENST00000590735 586 ntTSL 417.16■□□□□ 0.346e-6■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 BSCL2-217ENST00000524862 865 ntTSL 516.66■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 514.79□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 Z84485.1-201ENST00000526611 587 ntTSL 314.34□□□□□ -0.116e-6■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.296e-6■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 TPCN2-202ENST00000442692 4376 ntTSL 212.63□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.516e-6■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 ACLY-210ENST00000592970 540 ntTSL 411.32□□□□□ -0.66e-6■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 MIR4435-2HG-212ENST00000444301 666 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.656e-6■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.366e-6■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 BSCL2-223ENST00000531524 844 ntTSL 35.5□□□□□ -1.533e-7■■■■■ 115.9
SF3B1O75533 NSMAF-213ENST00000522645 582 ntTSL 319.49■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 115.7
SF3B1O75533 HACL1-204ENST00000421993 861 ntTSL 313.77□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 115.7
SF3B1O75533 HACL1-202ENST00000383779 1771 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 115.7
SF3B1O75533 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 115.7
SF3B1O75533 HACL1-201ENST00000321169 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 115.7
SF3B1O75533 HACL1-209ENST00000457447 1721 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 115.7
SF3B1O75533 PTK2B-211ENST00000519512 582 ntTSL 1 (best)11.09□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 115.7
SF3B1O75533 HACL1-205ENST00000422591 1637 ntTSL 510.82□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 115.7
SF3B1O75533 HACL1-213ENST00000628377 2214 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 115.7
SF3B1O75533 HACL1-207ENST00000451445 1734 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 115.7
SF3B1O75533 HACL1-208ENST00000456194 1880 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 115.7
SF3B1O75533 NSMAF-205ENST00000518229 581 ntTSL 48.2□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 115.7
SF3B1O75533 NSMAF-204ENST00000518159 582 ntTSL 35.82□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 115.7
SF3B1O75533 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 115.7
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1410.9 ms