Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPLO60437 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPLO60437 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPLO60437 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPLO60437 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPLO60437 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPLO60437 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms