Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms