Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNQ3O43525 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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