Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARPC5O15511 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms