Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms