Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms