Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms