Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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