Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf109Q9NX04 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf109Q9NX04 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf109Q9NX04 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf109Q9NX04 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf109Q9NX04 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf109Q9NX04 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf109Q9NX04 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf109Q9NX04 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf109Q9NX04 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf109Q9NX04 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf109Q9NX04 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf109Q9NX04 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf109Q9NX04 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms