Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms