Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms