Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms