Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms