Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms