Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms