Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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