Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms