Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms