Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms