Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.6 ms