Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms