Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR3

MED30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED30Q96HR3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED30Q96HR3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms