Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYTL4Q96C24 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYTL4Q96C24 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms