Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C11orf40Q8WZ69 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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C11orf40Q8WZ69 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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C11orf40Q8WZ69 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C11orf40Q8WZ69 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C11orf40Q8WZ69 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C11orf40Q8WZ69 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C11orf40Q8WZ69 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf40Q8WZ69 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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