Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 C9orf135-201ENST00000377197 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC025419.1-202ENST00000535315 744 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNKSR2Q8WXI2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms