Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms